Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SWSAP1Q6NVH7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWSAP1Q6NVH7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms