Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms