Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm5dQ62240 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms