Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF3Q5SZQ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CELF3Q5SZQ8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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