Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODF2Q5BJF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF2Q5BJF6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms