Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f8Q58FA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f8Q58FA4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms