Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc34Q3UI66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc34Q3UI66 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms