Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB5Q2M3G0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB5Q2M3G0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB5Q2M3G0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB5Q2M3G0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB5Q2M3G0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB5Q2M3G0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms