Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKIDA1Q1XH10 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms