Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sap25Q1EHW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sap25Q1EHW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sap25Q1EHW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms