Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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PDK4Q16654 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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