Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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