Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms