Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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