Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 CDC55YGL190C 1581 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 AMN1YBR158W 1650 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 MAK5YBR142W 2322 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RAP1YNL216W 2484 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 ARG81YML099C 2643 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RPN3YER021W 1572 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 GAL83YER027C 1254 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RPS19AYOL121C 435 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YOL134CYOL134C 390 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 PHO85YPL031C 918 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HPA2YPR193C 471 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 UBP7YIL156W 3216 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YPR204WYPR204W 3099 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HAA1YPR008W 2085 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HXT17YNR072W 1695 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 SOH1YGL127C 384 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YPT32YGL210W 669 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 MIC26YGR235C 702 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YJL028WYJL028W 336 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YOR203WYOR203W 354 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 IRC16YPR038W 360 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YPR174CYPR174C 666 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YBR178WYBR178W 375 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 GCD2YGR083C 1956 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 BDS1YOL164W 1941 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CLA4YNL298W 2529 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YPR148CYPR148C 1308 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YNL200CYNL200C 741 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 FYV5YCL058C 459 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RTK1YDL025C 1863 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RMD9YGL107C 1941 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 IRS4YKR019C 1848 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HES1YOR237W 1305 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YCR090CYCR090C 549 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 snR82snR82 268 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CNL1YDR357C 369 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YJR128WYJR128W 360 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 ASK1YKL052C 879 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 OPI8YKR035C 642 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HXT2YMR011W 1626 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 SKO1YNL167C 1944 nt6.09□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 COX15YER141W 1461 nt6.09□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 SSF1YHR066W 1362 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YCL068CYCL068C 783 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 MRPL11YDL202W 750 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 REC104YHR157W 549 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 LYS1YIR034C 1122 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 TPK3YKL166C 1197 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 NAP1YKR048C 1254 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 SUN4YNL066W 1263 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YNL170WYNL170W 396 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YOR082CYOR082C 342 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 EFT2YDR385W 2529 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 EFT1YOR133W 2529 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 MIP1YOR330C 3765 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YLL058WYLL058W 1728 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 TDP1YBR223C 1635 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 CDC5YMR001C 2118 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 KRE2YDR483W 1329 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 LYS9YNR050C 1341 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 QCR6YFR033C 444 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YHR097CYHR097C 1101 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 BCY1YIL033C 1251 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YJL220WYJL220W 453 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YJR038CYJR038C 363 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 INA17YPL099C 549 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 CSC1YLR241W 2349 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 STE24YJR117W 1362 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PLM2YDR501W 1566 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 TKL2YBR117C 2046 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 UBP6YFR010W 1500 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 DAL4YIR028W 1908 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 CIA1YDR267C 993 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 SPO73YER046W 432 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 BNA6YFR047C 888 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ZRT1YGL255W 1131 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PFD1YJL179W 330 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 DAD2YKR083C 402 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YBR090CYBR090C 369 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PGI1YBR196C 1665 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 THP1YOL072W 1368 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ASN1YPR145W 1719 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 CDC14YFR028C 1656 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 TAX4YJL083W 1815 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 DDC1YPL194W 1839 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 HPT1YDR399W 666 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PAU15YIR041W 375 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YAL004WYAL004W 648 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YJL119CYJL119C 324 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 LIA1YJR070C 978 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ERG2YMR202W 669 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ERP4YOR016C 624 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 CTP1YBR291C 900 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ISC1YER019W 1434 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 ASH1YKL185W 1767 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 EXO5YBR163W 1758 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YPD1YDL235C 504 nt6.04□□□□□ -1.44
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