Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YKE4YIL023C 1041 nt3.73□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YMR310CYMR310C 954 nt3.73□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YPR136CYPR136C 513 nt3.73□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 NTA1YJR062C 1374 nt3.73□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 FOX2YKR009C 2703 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 FRE4YNR060W 2160 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 TRI1YMR233W 681 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YNR042WYNR042W 429 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YNR068CYNR068C 819 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 YPL109CYPL109C 1974 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 SIN4YNL236W 2925 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 AEP2YMR282C 1743 nt3.72□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 TMA108YIL137C 2841 nt3.71□□□□□ -1.81
NFI1Q12216 ACK1YDL203C 1872 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 MGT1YDL200C 567 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YGL108CYGL108C 423 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 ENT3YJR125C 1227 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 MED11YMR112C 396 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 IZH2YOL002C 954 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YOR131CYOR131C 657 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YOR263CYOR263C 408 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YOR365CYOR365C 2112 nt3.71□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 HSP30YCR021C 999 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDL026WYDL026W 312 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RRP17YDR412W 708 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 IRC18YJL037W 675 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 IRC25YLR021W 540 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RPL15BYMR121C 615 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YNR065CYNR065C 3351 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RAD5YLR032W 3510 nt3.7□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 CEX1YOR112W 2286 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 SSM4YIL030C 3960 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RXT3YDL076C 885 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 KRE28YDR532C 1158 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YER076CYER076C 909 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 TEX1YNL253W 1269 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YOL024WYOL024W 519 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 MRPL51YPR100W 423 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YPR022CYPR022C 3402 nt3.69□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 STP1YDR463W 1560 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDR089WYDR089W 2610 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RRP8YDR083W 1179 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 TLG1YDR468C 675 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 TAM41YGR046W 1158 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YPT35YHR105W 645 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 BUR2YLR226W 1188 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YMR010WYMR010W 1218 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 GPI2YPL076W 843 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 SLX1YBR228W 915 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 UBX5YDR330W 1503 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RSF2YJR127C 4143 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 SEC2YNL272C 2280 nt3.68□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 TOP1YOL006C 2310 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 ALG8YOR067C 1734 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDL241WYDL241W 372 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDR340WYDR340W 303 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 POP6YGR030C 477 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YIR040CYIR040C 333 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 NRK1YNL129W 723 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 PFA4YOL003C 1137 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 HNT3YOR258W 654 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RPN1YHR027C 2982 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 ENA2YDR039C 3276 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 ENA1YDR040C 3276 nt3.67□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 CLN2YPL256C 1638 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 MSS4YDR208W 2340 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 TAO3YIL129C 7131 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 AIM7YDR063W 450 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 USE1YGL098W 738 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 AML1YGR001C 747 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 LSM1YJL124C 519 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YJR038CYJR038C 363 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 DID4YKL002W 699 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 NIT3YLR351C 876 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YLR444CYLR444C 303 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 SPO20YMR017W 1194 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 RPC34YNR003C 954 nt3.66□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YHR202WYHR202W 1809 nt3.65□□□□□ -1.82
NFI1Q12216 YDL186WYDL186W 834 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 MRPL6YHR147C 645 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PBA1YLR199C 831 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YBL036CYBL036C 774 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RLP7YNL002C 969 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YBL096CYBL096C 309 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 POS5YPL188W 1245 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YSA1YBR111C 696 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 KIN2YLR096W 3444 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 MIG1YGL035C 1515 nt3.65□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 BCS1YDR375C 1371 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DSS1YMR287C 2910 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PBI1YPL272C 1554 nt3.64□□□□□ -1.83
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