Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YGR051CYGR051C 324 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 IMP1YMR150C 573 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SSO2YMR183C 888 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RUF20RUF20 443 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 AAH1YNL141W 1044 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 MTH1YDR277C 1302 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RIT1YMR283C 1542 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 TPD3YAL016W 1908 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 CDC45YLR103C 1953 nt3.83□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YKL050CYKL050C 2769 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RDS1YCR106W 2499 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 VID27YNL212W 2349 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 GPI10YGL142C 1851 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 EXO70YJL085W 1872 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YGL108CYGL108C 423 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SEC65YML105C 822 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SIL1YOL031C 1266 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YBR096WYBR096W 693 nt3.82□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RRI1YDL216C 1323 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YBR238CYBR238C 2196 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 FUN12YAL035W 3009 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RDI1YDL135C 609 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 CDC8YJR057W 651 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 AIM26YKL037W 357 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 IRC25YLR021W 540 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 USB1YLR132C 873 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 ECM16YMR128W 3804 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 CTL1YMR180C 963 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 DDP1YOR163W 567 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 snR17asnR17a 333 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SUT2YPR009W 807 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SLA1YBL007C 3735 nt3.81□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 EPO1YMR124W 2832 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 HOM2YDR158W 1098 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RPS18AYDR450W 441 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 PPE1YHR075C 1203 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YOR263CYOR263C 408 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 HSH49YOR319W 642 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 MUM2YBR057C 1101 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 ECM8YBR076W 1065 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 MRPS9YBR146W 837 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 UBP12YJL197W 3765 nt3.8□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 UTP25YIL091C 2166 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 PPZ1YML016C 2079 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 PHM6YDR281C 315 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YDR526CYDR526C 471 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SIC1YLR079W 855 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RIB4YOL143C 510 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 USV1YPL230W 1176 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 HCA4YJL033W 2313 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YPR003CYPR003C 2265 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SWH1YAR042W 3567 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RIM4YHL024W 2142 nt3.79□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 DSN1YIR010W 1731 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 MRH4YGL064C 1686 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SPT10YJL127C 1923 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RRP14YKL082C 1305 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 AAD3YCR107W 1092 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 RNH202YDR279W 1053 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YDR355CYDR355C 303 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 POG1YIL122W 1056 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SOP4YJL192C 705 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 NIS1YNL078W 1224 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 COS1YNL336W 1146 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YOR114WYOR114W 885 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 YBR242WYBR242W 717 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SMI1YGR229C 1518 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 AVT7YIL088C 1473 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 IMH1YLR309C 2736 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 SER3YER081W 1410 nt3.78□□□□□ -1.8
VPS54Q12071 NRP1YDL167C 2160 nt3.78□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 JEN1YKL217W 1851 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PDR12YPL058C 4536 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 ORC4YPR162C 1590 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SYT1YPR095C 3681 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PRP11YDL043C 801 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YLL047WYLL047W 384 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YLR042CYLR042C 486 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SSP2YOR242C 1116 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PNG1YPL096W 1092 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 ATG26YLR189C 3597 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 TED1YIL039W 1422 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 DSL1YNL258C 2265 nt3.77□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 TRM12YML005W 1389 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SEC6YIL068C 2418 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 IMD4YML056C 1575 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 ISC10YER180C 804 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 FOL2YGR267C 732 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PET130YJL023C 1044 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RPS11BYBR048W 471 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 HPA2YPR193C 471 nt3.76□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 ULP1YPL020C 1866 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RAD26YJR035W 3258 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RRG1YDR065W 1098 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 FCF1YDR339C 570 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 EAF7YNL136W 1278 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 CAF20YOR276W 486 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.75□□□□□ -1.81
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