Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4A11Q02928 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms