Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD1Q02809 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD1Q02809 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms