Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfybP63139 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfybP63139 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfybP63139 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfybP63139 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfybP63139 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfybP63139 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfybP63139 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfybP63139 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfybP63139 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfybP63139 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfybP63139 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms