Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms