Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO4P61968 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO4P61968 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMO4P61968 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMO4P61968 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO4P61968 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms