Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTRNP46939 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UTRNP46939 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UTRNP46939 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTRNP46939 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UTRNP46939 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UTRNP46939 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UTRNP46939 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UTRNP46939 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTRNP46939 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTRNP46939 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTRNP46939 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UTRNP46939 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UTRNP46939 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms