Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM23P36406 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM23P36406 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM23P36406 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM23P36406 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM23P36406 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms