Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab17P35292 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms