Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms