Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
DNMT1P26358 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms