Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDCP19113 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDCP19113 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDCP19113 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDCP19113 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDCP19113 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDCP19113 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDCP19113 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDCP19113 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDCP19113 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDCP19113 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDCP19113 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDCP19113 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms