Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18528 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18528 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18528 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P18528 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18528 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18528 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18528 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18528 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18528 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18528 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18528 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18528 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms