Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NeflP08551 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NeflP08551 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NeflP08551 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NeflP08551 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NeflP08551 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeflP08551 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeflP08551 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
NeflP08551 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeflP08551 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeflP08551 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeflP08551 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms