Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms