Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPM3O75607 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPM3O75607 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPM3O75607 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPM3O75607 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPM3O75607 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPM3O75607 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPM3O75607 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPM3O75607 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPM3O75607 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPM3O75607 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms