Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR5O60602 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR5O60602 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms