Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms