Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPLO15194 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPLO15194 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms