Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp12O08736 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp12O08736 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms