Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Usp32F8VPZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp32F8VPZ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms