Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd50F7BE84 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd50F7BE84 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ankrd50F7BE84 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms