Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930426L09RikE9Q0N7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930426L09RikE9Q0N7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930426L09RikE9Q0N7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930426L09RikE9Q0N7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms