Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms