Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia1B2RXQ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia1B2RXQ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms