Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17087V9GXQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17087V9GXQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17087V9GXQ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17087V9GXQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17087V9GXQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17087V9GXQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm17087V9GXQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17087V9GXQ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17087V9GXQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17087V9GXQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17087V9GXQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm17087V9GXQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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