Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Knop1Q9Z2Q2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knop1Q9Z2Q2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knop1Q9Z2Q2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knop1Q9Z2Q2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Knop1Q9Z2Q2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knop1Q9Z2Q2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knop1Q9Z2Q2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Knop1Q9Z2Q2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Knop1Q9Z2Q2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knop1Q9Z2Q2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knop1Q9Z2Q2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Knop1Q9Z2Q2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Knop1Q9Z2Q2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms