Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Thbs4Q9Z1T2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Thbs4Q9Z1T2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Thbs4Q9Z1T2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Thbs4Q9Z1T2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Thbs4Q9Z1T2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Thbs4Q9Z1T2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Thbs4Q9Z1T2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Thbs4Q9Z1T2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Thbs4Q9Z1T2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Thbs4Q9Z1T2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs4Q9Z1T2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,9 ms