Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VarsQ9Z1Q9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VarsQ9Z1Q9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VarsQ9Z1Q9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VarsQ9Z1Q9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VarsQ9Z1Q9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VarsQ9Z1Q9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VarsQ9Z1Q9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms