Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb6Q9Z0T9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb6Q9Z0T9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb6Q9Z0T9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb6Q9Z0T9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb6Q9Z0T9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb6Q9Z0T9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb6Q9Z0T9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb6Q9Z0T9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb6Q9Z0T9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms