Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms