Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stxbp4Q9WV89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stxbp4Q9WV89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stxbp4Q9WV89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stxbp4Q9WV89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stxbp4Q9WV89 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stxbp4Q9WV89 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stxbp4Q9WV89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stxbp4Q9WV89 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stxbp4Q9WV89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stxbp4Q9WV89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Stxbp4Q9WV89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms