Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nme4Q9WV84 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nme4Q9WV84 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme4Q9WV84 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme4Q9WV84 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme4Q9WV84 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme4Q9WV84 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme4Q9WV84 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nme4Q9WV84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nme4Q9WV84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme4Q9WV84 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme4Q9WV84 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms