Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx1Q9WV80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx1Q9WV80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx1Q9WV80 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx1Q9WV80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx1Q9WV80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx1Q9WV80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx1Q9WV80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx1Q9WV80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms